記者2日從中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉,該院椰子研究所近日首次公開(kāi)在《大數(shù)據(jù)科學(xué)》(《GigaScience》)雜志上發(fā)表了海南高種椰子的全基因組測(cè)序。
據(jù)了解,此前,對(duì)椰子的全基因組測(cè)序研究在行業(yè)內(nèi)是一片空白。從2013年開(kāi)始,中國(guó)熱科院椰子研究所聯(lián)合熱帶生物技術(shù)研究所、華大基因和法國(guó)農(nóng)業(yè)國(guó)際合作研究中心(CIRAD)自籌經(jīng)費(fèi)展開(kāi)研究,于2015年首次完成椰子的基因組序列拼接,成功發(fā)現(xiàn)椰子擁有282個(gè)特有基因家族,這些信息為椰子功能基因組的研究奠定了良好基礎(chǔ)。
科學(xué)家根據(jù)全基因組測(cè)序研究,便可從基礎(chǔ)原理解釋?zhuān)阂訛槭裁瓷L(zhǎng)在海邊?為什么椰子的油含量很高,并且富含水分?為什么有的椰子3年開(kāi)花,有的8年開(kāi)花?
該研究團(tuán)隊(duì)專(zhuān)家介紹,海南高種椰子基因組能為椰子以及棕櫚科作物耐鹽、抗旱、抗寒、高油等功能基因的挖掘提供參考,也可以解釋椰子高油、耐鹽、抗風(fēng)等原理,對(duì)椰子重要農(nóng)藝性狀的解析及全基因組關(guān)聯(lián)分析提供參考體系。“全基因組測(cè)序工作的完成,好比繪制了一張椰子基因地圖,科學(xué)家可按圖索驥,培育更高產(chǎn)、耐旱、抗病的優(yōu)質(zhì)新品種,育種周期將大大縮短,改變椰子新品種單一的現(xiàn)象。”
據(jù)悉,椰子作為重要的熱帶水果以及油料作物,當(dāng)?shù)卦S多民眾直接或間接從業(yè)椰子產(chǎn)業(yè),對(duì)海南地方經(jīng)濟(jì)和社會(huì)的發(fā)展起著非常重要作用。
研究團(tuán)隊(duì)專(zhuān)家表示,目前圍繞基因組序列數(shù)據(jù)基礎(chǔ),一個(gè)高密度的遺傳圖譜及更精細(xì)的椰子基因組圖譜正在構(gòu)建中,棕櫚染色體的演化及椰子耐鹽的特性的組學(xué)分析工作也將于近期完成。
目前,來(lái)自法國(guó)、澳大利亞、斯里蘭卡、印度等國(guó)的椰子研究單位已向中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院表達(dá)深度合作意向。(完)
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