DNA機(jī)器人:巨大的一小步
作為納米前沿科技快速發(fā)展的產(chǎn)物,加州理工大學(xué)“錢實(shí)驗(yàn)室”的DNA機(jī)器人步子又小又緩慢。它走一步需要5分鐘,步長(zhǎng)6納米,差不多是人類一步的600萬(wàn)分之一。
它只有20納米長(zhǎng),大約是一粒米的千分之一。它看起來像根線蟲,身子細(xì)長(zhǎng),沒有臉,蛇一般纏來纏去。它的活動(dòng)場(chǎng)地是一塊DNA合成物的平板,隱藏在試管里——因?yàn)樘×?,需要被注射進(jìn)去。
板子上分布著兩種顏色的分子小球。這條“線蟲”游來游去,撿起小球送到指定的位置。兩種顏色分開擺放。
它是世界上首例可以同時(shí)完成行走、抓起、放下和分類工作的DNA機(jī)器人。今年9月,《科學(xué)》雜志發(fā)表了有關(guān)它的論文。
“這是DNA機(jī)器人的重要一步。”杜克大學(xué)工程學(xué)教授約翰·賴夫說。他自21世紀(jì)初就開始關(guān)注DNA合成研究的發(fā)展。
對(duì)更多人來說,這段跋涉還在肉眼無(wú)法看見的維度之中。
建筑是DNA與生俱來的能力
DNA機(jī)器人和出現(xiàn)在大眾媒體上的機(jī)器人不太一樣。后者的代表是由施瓦辛格扮演的硬漢“終結(jié)者”或拖著履帶條的大眼睛瓦力。而據(jù)錢實(shí)驗(yàn)室的管理者、加州理工大學(xué)助理教授錢璐璐介紹,自己實(shí)驗(yàn)室的這個(gè)小家伙在不和其他同伴纏繞時(shí),差不多就是“一條軟軟的彈力繩”。
和那些金屬家伙不同,它的血肉由核苷酸構(gòu)成。后者也是脫氧核糖核酸,即DNA的組成物。這也是它名字的由來。
20世紀(jì)80年代,一名叫納德里安·西曼的紐約晶體學(xué)家逐漸意識(shí)到,大名鼎鼎的DNA不僅僅是生命秘密的所在,還可以是一種絕佳的建筑材料。
西曼那會(huì)兒留著大胡子,是個(gè)喜歡在講座里開玩笑的年輕教授。他在實(shí)驗(yàn)室的工作進(jìn)行得不太愉快——通過改變條件不斷實(shí)驗(yàn)析出結(jié)晶,以期獲得理想的分子成果,卻總是不盡人意。
他突然開了腦洞:能不能讓核酸自己組合出結(jié)果呢?
畢竟,這是大自然做了千萬(wàn)年的事情,建筑是DNA與生俱來的能力。
眾所周知,DNA是兩條纏繞在一起的雙螺旋。具有互補(bǔ)序列的核苷酸,即A和T、C和G相遇,一定會(huì)配上對(duì),伸出小觸手緊緊握住對(duì)方,搭出螺旋向上的階梯。
從這個(gè)角度來看,納米生物學(xué)實(shí)驗(yàn)一下子變成了媽媽織毛衣。只要將序列互補(bǔ)的DNA丟在一起,它們自然會(huì)組合出成果。不需要粘合劑,不需要楔子和釘槍,化學(xué)承擔(dān)了所有工作。線頭互相纏繞,毛線延伸的方向千變?nèi)f化,可以彼此正著纏、反著纏、夾花兒纏。
編織毛衣的“毛線”從DNA上切割下來,刀子則是限制酶。被切下的長(zhǎng)長(zhǎng)DNA縷(strand)并不像毛線那樣光滑,而長(zhǎng)著大大小小蜈蚣腳式的尖端。那些格外突出的尖端被稱作黏狀末端,顧名思義,可以在未來的編織中起到粘連的作用。它們是毛衣的線頭。
通過織毛衣式的人工合成,1982年,西曼獲得了一副DNA編就的井字花。實(shí)際上,30年來,這個(gè)領(lǐng)域的成果圖仿佛一本大型毛線手工書。
西曼和他的后繼者不斷使用新的編碼,改變切割的長(zhǎng)短,變換纏繞的方式,制造出花樣繁多的DNA分子結(jié)構(gòu)成果。有連續(xù)不斷如羅馬地磚式的2維圖案,也有3維的繡球,甚至可以在分子平面上排列出一個(gè)笑臉。DNA的“毛線”恪盡職守地排列組合,仿佛運(yùn)動(dòng)會(huì)開幕式上的團(tuán)體操表演。
DNA人工合成物不僅能組成靜態(tài)的圖案,還能造就可以自主動(dòng)作的機(jī)器人。人類能通過編碼來設(shè)計(jì)合成物的運(yùn)動(dòng)方式。
這同樣少不了自然的幫忙。DNA是編碼的天然材料。它能儲(chǔ)存大量信息,因此可以被設(shè)計(jì)進(jìn)行活動(dòng)。編碼的基礎(chǔ)簡(jiǎn)潔明了——序列。此外,很多信號(hào)能夠被轉(zhuǎn)化成自然信號(hào)。
錢璐璐團(tuán)隊(duì)的機(jī)器人擁有兩只“腳”,一條“手臂”和一只“手”。它活動(dòng)在一個(gè)一個(gè)特殊的分子表面上,這個(gè)平面由短促的DNA合成物組成,像一塊釘板。釘子上散落安放著需要被分類的小球。
機(jī)器人的腳和釘子上都被安放了DNA片段。序列互補(bǔ),片段彼此吸引,腳就在釘子上踩實(shí)了。長(zhǎng)條狀的機(jī)器人從而穩(wěn)穩(wěn)地攀上釘子,像一只蛇蜿蜒爬上短樁。
通過編碼,兩只腳不能同時(shí)踩在一顆釘子上。當(dāng)機(jī)器人行動(dòng)時(shí),它只需用閑著的那只腳攀上想到達(dá)的那顆釘子,踩在原來釘子上的腳就會(huì)自動(dòng)松開。它悠游在釘板上,像深草間躍動(dòng)的一只彈簧。
機(jī)器人對(duì)小球的分類同樣是依靠序列的幫忙實(shí)現(xiàn)的。小球上帶有兩截DNA片段,一截吸引機(jī)器人自由晃動(dòng)的手掌,從而能被拾起。一截吸引目的地的釘子,從而能被放下。兩種不同顏色的貨物要被送到不同的目的地,因此配對(duì)的標(biāo)記不一樣。
工作時(shí),機(jī)器人被設(shè)計(jì)遵循最簡(jiǎn)單的行為法則:亂逛、隨緣。你家的掃地機(jī)器人滿屋亂轉(zhuǎn),遇到灰塵就吃掉,DNA機(jī)器人也如此。手里空空時(shí),遇見貨物就撿起來。拿著貨物時(shí),遇到目的釘子就放下。
“這樣的漫游不會(huì)耗費(fèi)一點(diǎn)兒能量?!卞X璐璐說。
“真是美麗的工作?!币晃换瘜W(xué)家在自己的視頻網(wǎng)站頻道對(duì)此評(píng)價(jià)道,“說起機(jī)器人,總會(huì)想到機(jī)械控制和電腦,而她們看到了其他的方向、自然的一面?!?/p>
DNA機(jī)器人搬“珠子”,準(zhǔn)確率接近百分百
“它們可以抵達(dá)人類到不了的地方。機(jī)電機(jī)器人被送去火星,它們則可以被送到血液循環(huán)里,精準(zhǔn)運(yùn)輸送達(dá)藥物?!卞X璐璐對(duì)媒體表示。
錢璐璐團(tuán)隊(duì)的“彈力繩”并不缺少同類。近10年間,科學(xué)家運(yùn)用人工合成DNA制造出了不同功能的分子機(jī)器人。
一個(gè)長(zhǎng)得像帶蓋小水桶的家伙可能是打擊癌癥的最新武器。2012年9月,韋斯生物啟發(fā)工程研究所在《科學(xué)》上發(fā)表論文,推出了一種新型DNA機(jī)器人。
水桶內(nèi)盛放著藥物,水桶外壁裝著鎖——雙螺旋緊緊纏繞,筒體的兩部分因而牢牢閉合,保證藥物不灑出來。
打開鎖的鑰匙是一種特定的蛋白。一旦鎖上的一小縷DNA識(shí)別到了這種蛋白,會(huì)轉(zhuǎn)而附著在上面,從而松開鎖體的螺旋,打開整個(gè)水桶。
研究者希望,它可以在人體的海洋中游走,安然繞過健康的組織,穿過鮮紅的血液洪流,只有與黑壓壓的病變細(xì)胞正面交鋒時(shí),才被激發(fā),吐出深藏在胸中的炮火。
這種精準(zhǔn)而有效的攻擊,使它更像一臺(tái)人體內(nèi)的殲擊機(jī),區(qū)別于傳統(tǒng)癌癥化療的無(wú)差別攻擊。
目前,這些DNA機(jī)器人還只能在試管中活動(dòng),遠(yuǎn)談不上進(jìn)入人體治病。澳大利亞莫那什大學(xué)的納米生物學(xué)專家陳文龍?jiān)诮邮苊襟w采訪時(shí)對(duì)錢團(tuán)隊(duì)的工作大加贊賞,但他同時(shí)也表示:如果機(jī)器人貿(mào)然進(jìn)入人體,合成DNA攜帶的基因編碼很可能會(huì)擾亂人體本來的基因信息。
科學(xué)家的工作重心正集中在怎樣讓這些小家伙步子邁得更快一點(diǎn)。
今年春天,中科院上海應(yīng)用物理研究所與華東師范大學(xué)的團(tuán)隊(duì)合作,在《應(yīng)用化學(xué)》發(fā)表論文,介紹了他們構(gòu)建的一種新機(jī)器人,能夠通過核酸外切酶驅(qū)動(dòng),實(shí)現(xiàn)更高效的行走。
錢璐璐團(tuán)隊(duì)則采取了集團(tuán)作戰(zhàn)的戰(zhàn)術(shù)。單個(gè)機(jī)器人做完兩種顏色12顆“珠子”的分類需要一整天。他們繼而往這片“工地”增加更多的機(jī)器人幫手。DNA機(jī)器人各走各道,效率大大提高,一天的工作被縮短到了幾個(gè)小時(shí),準(zhǔn)確率保持在接近百分之百。
這也是DNA機(jī)器人研究一直以來的一個(gè)思路:個(gè)體力量再小,團(tuán)結(jié)起來也威力無(wú)窮。
未來,錢璐璐希望能模仿集體出動(dòng)完成任務(wù)的螞蟻,讓機(jī)器人留下能被同伴辨識(shí)的信號(hào),從而提高漫游不準(zhǔn)確的效率。
“很多(DNA機(jī)器人)在未來可能的應(yīng)用目前還屬于科幻小說的范疇。”錢璐璐說。
生命也是一個(gè)程序,自然是寫就它的程序員
“盡管它們目前仍然又緩慢又簡(jiǎn)單,DNA機(jī)器人已經(jīng)顯現(xiàn)出超越微電子機(jī)器人的種種優(yōu)勢(shì)了。”杜克大學(xué)的約翰·賴夫表示。
他經(jīng)歷了DNA研究的分岔口。上世紀(jì)末,DNA與數(shù)據(jù)天然緊密的關(guān)系,讓不少科學(xué)家堅(jiān)信能制造出一臺(tái)DNA計(jì)算機(jī)。但經(jīng)過不斷實(shí)驗(yàn),他們中的一些感到越來越深重的懊惱:自己的成果遠(yuǎn)遠(yuǎn)趕不上已經(jīng)存在并仍在飛速發(fā)展的微電子計(jì)算機(jī)。
他們提出:應(yīng)該讓DNA做自己最擅長(zhǎng)的工作,在有機(jī)組織或其他類似的環(huán)境里進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。微電子電腦可去不了那里。
錢璐璐實(shí)驗(yàn)室的年輕團(tuán)隊(duì)是這波潮流的最新繼任者。他們中有醉心于 “不存在于自然中卻和自然造物一樣復(fù)雜”合成物的化學(xué)家,也有獲得了醫(yī)學(xué)博士學(xué)位的程序員。這個(gè)實(shí)驗(yàn)室共同的興趣是:編碼。
在制造機(jī)器人的過程中,他們總在提醒自己:簡(jiǎn)單、更簡(jiǎn)單一點(diǎn)。機(jī)器人的算法盡量簡(jiǎn)單,工作的邏輯遵循“是”或“否”的簡(jiǎn)短流程。連形態(tài)都是一個(gè)簡(jiǎn)單的線條,沒有千絲萬(wàn)縷的編織造型。
這是因?yàn)椋骸霸胶?jiǎn)單,越可能被作為基礎(chǔ),添加上各種新的功能?!彼麄兊哪繕?biāo)不是把某項(xiàng)具體任務(wù)做到盡善盡美,而是開發(fā)盡可能多的綜合用途。
“我和我實(shí)驗(yàn)室的興趣,是建造這些原子機(jī)器人的工程原則。”錢璐璐說。
利用工程原則,程序員和工程師打造了一整個(gè)微電子世界,從小小的轉(zhuǎn)化器到我們所熟悉的各種機(jī)器人。同樣,分子生物世界也可以從簡(jiǎn)單到千變?nèi)f化。
在錢璐璐眼中,生命也是一個(gè)程序。自然是寫就它的程序員,分子是搭載它的平臺(tái)。不同的程序序列,能制造出昆蟲、細(xì)菌或者小貓咪。
然而,我們對(duì)生命這個(gè)程序的應(yīng)用仍然十分有限?!懊刻煊谐^1000種iPhone應(yīng)用誕生,分子的‘應(yīng)用’數(shù)量卻遠(yuǎn)遠(yuǎn)不及。”
“人類能有機(jī)會(huì)利用整個(gè)分子生物系統(tǒng)的編程空間嗎?”錢璐璐在2016年的一次演講中自問。
她在加州理工大學(xué)的個(gè)人頁(yè)面上寫道:“自然蘊(yùn)藏著我們所尋覓的所有美麗和真理,但尋求的旅程還需要被心中的火焰所照亮。”
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